แผนกแผน  มีหน้าที่จัดทำแผนปฏิบัติการด้านนิวเคลียร์ ชีวะ เคมี และแผนอื่น ๆ ที่เกี่ยวข้อง

       แผนกปฏิบัติการนิวเคลียร์ ชีวะ เคมี  มีหน้าที่ดำเนินการเกี่ยวกับการปฏิบัติการสงครามนิวเคลียร์ ชีวะ เคมี การต่อต้านการก่อการร้ายที่มีการใช้อาวุธที่มีอานุภาพทำลายล้างสูง การบรรเทาสาธารณภัย จากสารเคมีและวัตถุอันตราย และการปฏิบัติการอื่น ๆ ที่เกี่ยวข้องตลอดจนให้คำแนะนำทางด้านเทคนิค และฝึกเตรียมความพร้อม และสนับสนุนด้านนิวเคลียร์ ชีวะ เคมี ให้กับหน่วยต่าง ๆ

       แผนกสนับสนุน  มีหน้าที่สนับสนุนและดูแลยุทโธปกรณ์ด้านนิวเคลียร์ ชีวะ เคมี ให้มีความพร้อม